农村土地确权证该哪个部门办理

农村土地确权证应由国土资源部门办理。

农村土地确权证是指对农村集体土地所有权、使用权等进行确认和登记的证书。在中国，办理农村土地确权证的部门主要是国土资源部门。具体流程如下：

1. 准备材料：包括土地权属来源证明、土地承包合同、土地使用现状证明等。

2. 申请登记：农户或村集体向所在地的国土资源管理部门提交申请。

3. 权属调查：国土资源部门对申请的土地进行实地调查，核实土地权属和现状。

4. 审核批准：国土资源部门对调查结果进行审核，对符合要求的申请进行批准。

5. 登记发证：对批准的申请进行登记，并颁发农村土地确权证。